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核酸染色劑對DNA在瓊脂糖凝膠電泳中遷移速度的影響

薄秀梅 徐州醫科大學基礎醫學院國家級基礎醫學實驗教學示范中心; 江蘇徐州221004

關鍵詞:eb gelred 遷移速度 瓊脂糖凝膠電泳 

摘要:核酸染色應用在許多DNA檢測相關的技術領域,然而染色劑結合DNA會造成電泳遲滯。為研究溴化乙錠(ethidium bromide,EB)和GelRed這2種核酸染色劑對DNA在瓊脂糖凝膠電泳中遷移速度的影響,分別用這2種染色劑采用前、后染色的方法對DNA進行染色,以瓊脂糖凝膠電泳作為檢測方法,凝膠成像系統拍照觀察,用Reptation理論分析數據。研究結果表明EB和GelRed染色均使DNA遷移發生了滯后,但EB對于目的基因片段大小的判讀未受電泳滯后的影響,而GelRed對目的基因判讀略有影響。然而,與EB相比,GelRed具有熒光效果強、安全、環保等諸多優點。總之,需要精確鑒定目的基因片段大小可以選擇后染色或EB前染色,對于鑒定目的基因片段大小要求不高且需要熒光效果好、環保的染色劑可以選擇GelRed。

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