黃山市2018年兩起暴發疫情諾如病毒分子分型與基因特征分析

程鵬; 史永林; 楊小雙; 張忠心 黃山市疾病預防控制中心; 安徽黃山245000; 安徽省疾病預防控制中心; 安徽合肥230601; 黟縣疾病預防控制中心; 安徽黃山245500

關鍵詞:諾如病毒 分子分型 進化分析 暴發疫情 

摘要:目的了解黃山市暴發疫情諾如病毒分子分型與基因特征。方法收集黃山市2018年兩起暴發疫情中具有胃腸炎癥狀患者的肛拭子標本37份,采用實時熒光定量聚合酶鏈式反應(Real-time PCR)對采集的標本進行諾如病毒核酸檢測,檢出的陽性標本,采用逆轉錄-聚合酶鏈式反應(RT-PCR)擴增病毒衣殼區和聚合酶區,并對PCR產物進行基因測序及分子分型鑒定,測序結果使用Mega 6.0軟件構建進化樹進行遺傳進化分析。結果 37份標本中,16份標本諾如病毒核酸陽性,其中11份測序成功,BLAST比對結果顯示11條序列均為諾如病毒GII.P16-GII.2基因型。兩起疫情中檢出的諾如病毒序列與福建泉州、江蘇泰州、南京和安徽宿州的毒株序列同源性較高。結論 GII.P16-GII.2基因型諾如病毒是引起黃山市黟縣兩起急性胃腸炎暴發疫情的主要病原體。

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