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基于SSR標記分析四川省桑樹種質資源的群體結構和遺傳多樣性

劉玲; 陳祥平; 范小敏; 傅曉; 柯皓天; 呂銀; 陳仁芳 四川省絲綢工程技術研究中心; 成都610031; 四川省絲綢科學研究院; 成都610031

關鍵詞:桑樹種質資源 ssr分子標記 群體結構 遺傳多樣性 四川省 

摘要:利用14對SSR引物對四川省89份桑樹種質資源的基因組DNA進行PCR,分析種質資源間的群體結構和遺傳多樣性。共擴增出遷移率不同的條帶65條,多態性條帶65條,多態性條帶比率達100%;Structure群體結構分析將89份桑樹種質資源劃分為4個群體,4個群體的多態性信息含量在0.552 0~0.599 8之間,總體為0.657 7;基因多樣度在0.554 8~0.600 3之間,總體為0.579 0;等位基因數目在66~76個之間,總體為134個;等位基因豐富度在3.327 2~3.549 1之間,總體為3.983 1;遺傳多樣性主要來源于品種內,屬中等偏高水平;14對SSR引物位點的總基因多樣度Ht在0.291~0.931之間,整體為0.699;Nei’s種群內基因多樣度Hs為0.287~0.910,整體為0.662;種群間基因多樣度為0.003~0.098,整體為0.037;種群間基因分化系數為0.008~0.047,整體為0.053;基因流為2.901~62.000,整體為8.934,遺傳變異主要發生在群體內,群體間分化程度低,基因流大。UPGMA聚類分析與群體結構分析結果大致相同,2種分析結果都顯示分群無地理遷移規律。

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