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綿羊IGFBP-3基因的克隆及序列分析

周明亮; 楊平貴; 吳登俊; 張翔宇 四川省草原科學(xué)研究院; 四川成都611743; 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院; 四川雅安625014; 四川省畜牧科學(xué)研究院; 四川成都611741

關(guān)鍵詞:克隆 基因 綿羊 

摘要:旨在克隆IGFBP-3基因的CDS序列及其生物信息學(xué)分析,試驗(yàn)以涼山半細(xì)毛羊?yàn)檠芯繉ο螅捎肦T-PCR方法克隆了IGFBP-3基因的CDS全序列,生物信息學(xué)方法深入分析其序列。結(jié)果表明:IGFBP-3基因的CDS序列為882bp,編碼293個(gè)氨基酸,與牛、人、鼠的CDS同源性分別為94%、83%、81%,氨基酸序列同源性分別為91%、77%、79%,GenBank登錄號為FJ752574;IGFBP-3基因的氨基酸分子量為31.5KD,理論等電點(diǎn)(pI)為8.98;進(jìn)化分析顯示與牛、山羊等哺乳動(dòng)物關(guān)系較近,與雞、魚類等親緣關(guān)系較遠(yuǎn);IGFBP-3基因存在明顯的疏水性區(qū)域和親水性區(qū)域,有一個(gè)信號肽、25個(gè)磷酸化位點(diǎn)、7個(gè)N-糖基化位點(diǎn)和4個(gè)O-糖基化位點(diǎn);二級結(jié)構(gòu)分析顯示無規(guī)卷曲、α-螺旋和β-折疊區(qū)域分別為73.04%、13.99%、12.97%;三級結(jié)構(gòu)分析顯示存在IGFBP—N和甲狀腺球蛋白-Ⅰ型功能域。為進(jìn)一步研究綿羊IGFBP一3基因的功能奠定基礎(chǔ)。

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