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馬氏珠母貝TRADD基因克隆與組織表達(dá)分析

何軍軍; 梁海鷹; 陳崧; 房曉宸; 黃雪敏 廣東海洋大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院; 廣東湛江524088

關(guān)鍵詞:馬氏珠母貝 腫瘤壞死因子受體相關(guān)死亡域蛋白 基因克隆 實(shí)時(shí)熒光定量 

摘要:【目的】克隆馬氏珠母貝(Pinctada martensii)腫瘤壞死因子受體相關(guān)死亡域蛋白(TRADD)基因,并分析其在各組織中的表達(dá)。【方法】利用cDNA末端快速擴(kuò)增技術(shù)(RACE)克隆獲得馬氏珠母貝PmTRADD基因的cDNA全長(zhǎng)序列,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)方法分析PmTRADD基因在馬氏珠母貝不同組織中的表達(dá)模式。【結(jié)果與結(jié)論】PmTRADD包含5′非編碼區(qū)101bp,3′非編碼區(qū)144bp和開放閱讀框(ORF)591bp,編碼196個(gè)氨基酸。序列分析表明,PmTRADD沒有信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu)域,C端含有一個(gè)死亡結(jié)構(gòu)域(DEATH)。將PmTRADD死亡結(jié)構(gòu)域的氨基酸序列與其他物種的TRADD死亡結(jié)構(gòu)域序列進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)不同物種的TRADD死亡結(jié)構(gòu)域序列同源性較低。PmTRADD在馬氏珠母貝各組織中均有不同程度表達(dá),在鰓組織中表達(dá)最高,肝胰腺次之,閉殼肌中基本無表達(dá)。

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