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可變剪接在肺腺癌預(yù)后中的價(jià)值

張世超; 歐陽(yáng)燕; 蘭應(yīng)武; 唐福州; 胡祖權(quán); 曾柱 貴州醫(yī)科大學(xué)生物與工程學(xué)院; 貴州貴陽(yáng)550025; 貴州醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院; 貴州貴陽(yáng)550025

關(guān)鍵詞:肺腫瘤 預(yù)后 肺腺癌 可變剪接 臨床結(jié)果 

摘要:目的:探討可變剪接在肺腺癌預(yù)后中的作用。方法:在TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中收集474例肺腺癌組織的RNA-seq數(shù)據(jù),繪制可變剪接圖譜;通過(guò)單因素Cox回歸分析確定肺腺癌中存活相關(guān)的剪接事件,再利用最小絕對(duì)收縮模型篩選用于監(jiān)測(cè)存活的預(yù)后因子;收集5例肺腺癌患者的癌組織,采用PCR擴(kuò)增及瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)CHEK 1、KIF 23、MCM 7和FN 1的mRNA亞型條帶。結(jié)果:在肺腺癌中存在著大量的可變剪接事件并與預(yù)后相關(guān),包括CHEK 1、KIF 23、MCM 7和FN 1,通過(guò)生物信息學(xué)利用可變剪接事件構(gòu)建了高效的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)模型;KEGG途徑分析表明,主要富集的基因與““regulation of autophagy”、“central carbon metabolism in cancer”和“cell cycle”有關(guān);5例肺腺癌患者的癌組織PCR擴(kuò)增結(jié)果顯示,可變剪接核心基因CHEK1、KIF23、FN1確實(shí)存在CHEK1-AP-19309、KIF23-AP-31390、FN1-ES-57398等剪接體。結(jié)論:可變剪接事件可作為預(yù)測(cè)肺腺癌患者臨床結(jié)果的指標(biāo),可為肺腺癌患者制定個(gè)體化治療方案提供依據(jù)。

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