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基于通路和網絡方法對重度抑郁癥和阿爾茨海默癥易感基因的分析

樊婷; 王舉 天津醫科大學生物醫學工程與技術學院; 天津300070

關鍵詞:重度抑郁癥 阿爾茨海默癥 通路富集分析 蛋白質互作網絡 風險基因 

摘要:目的運用通路富集和網絡分析的方法揭示重度抑郁癥(major depressive disorder,MDD)和阿爾茨海默癥(Alzheimer’s disease,AD)的共病生物過程和異常通路,預測潛在風險基因。方法對MDD或AD易感基因進行通路和網絡分析,構建主要重疊通路的串話網絡,通過提取MDD和AD特異性蛋白質相互作用子網絡,確定與這兩種疾病相關的潛在風險基因。結果研究得到255個MDD易感基因和587個AD易感基因以及46個共享基因。通過分析確定了48條與免疫系統、信號轉導系統、內分泌系統等顯著性共病通路。最后分析特異性子網絡,預測出5個潛在風險基因:HSP90AA1、ELAVL1、CEBPB、HSP90AB1和YBX1。結論MDD與AD共病可能是多種分子和通路的功能異常引起的,且MDD易感基因可能在共病中發揮主要作用。

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