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擬南芥AtSWEET4基因啟動子序列、編碼蛋白結構分析及其在病原菌脅迫下表達特性檢測

劉曉柱; 李銀鳳 貴州理工學院; 貴陽550000

關鍵詞:擬南芥 理化性質 結構特征 啟動子序列 病原菌脅迫 

摘要:【目的】分析擬南芥糖運輸載體蛋白基因(AtSWEET4)啟動子序列及其編碼蛋白的結構,并檢測病原菌脅迫下AtSWEET4基因的表達特性,為研究AtSWEET4蛋白在擬南芥生長發育和生物脅迫中的作用機制提供理論依據。【方法】采用生物信息學方法分析AtSWEET4基因啟動子序列及其編碼蛋白的結構,并采用實時熒光定量PCR(qRTPCR)和β-葡萄糖苷酸酶(GUS)組織染色法檢測人工接種菜豆暈疫病菌(Pseudomonas syringae pv. phaseolicola,Psp)NPS3121和丁香假單胞菌番茄致病變種(Pseudomonas syringae pathovar tomato,Pst)DC3000后AtSWEET4基因的表達情況。【結果】AtSWEET4蛋白由251個氨基酸組成,分子量為27.8 kD,分子式為C1300H2038N304O346S11,理論等電點(pI)為8.71,脂肪氨基酸指數為118.76,不穩定指數為38.72,平均親水性指數為0.629,為穩定的親水蛋白,且含有7個跨膜結構域,無信號肽,為非分泌型蛋白。AtSWEET4蛋白與芥屬的亞麻薺和薺菜SWEET4蛋白親緣關系最近,其次是十字花科的甘藍和蘿卜SWEET4蛋白,與禾本科的二穗短柄草SWEET4蛋白親緣關系最遠。AtSWEET4基因啟動子序列中包含核心元件TATA-box、增強子元件CAAT-box、調控植物生長發育相關元件、激素響應相關元件、非生物脅迫響應相關元件和生物脅迫響應相關元件。Psp NPS3121和Pst DC3000均可誘導AtSWEET4基因表達,但表達模式不同:接種Psp NPS3121后6和12 h的AtSWEET4基因表達明顯上調,但至接種后24 h又迅速下降;接種Pst DC3000后AtSWEET4基因表達量逐漸增加。【結論】AtSWEET4基因的啟動子序列特征及其編碼蛋白結構與其參與植物免疫反應密切相關。

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