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GWAS結合共表達網絡分析挖掘影響油菜種子硫苷積累的作用位點

劉蔚; 姚敏; 康郁; 王美; 解盼; 何昕; 劉忠松; 官春云; 錢偉; 華瑋; 錢論文 湖南農業大學南方糧油作物協同創新中心; 長沙410128; 中國農業科學院油料作物研究所/農業部油料作物生物學與遺傳育種重點開放實驗室; 武漢430062; 西南大學農學與生物科技學院; 重慶400716

關鍵詞:甘藍型油菜 硫苷含量 單體型 共表達 

摘要:降低菜籽油中硫苷(glucosinolate, GSL)的含量對菜籽油品質改良具有重要意義。本研究以203份中國半冬性油菜(Brassica napus)自交系為材料,利用蕓薹屬60K SNP芯片對油菜種子硫苷含量進行全基因組關聯分析(genome-wide association study, GWAS),共檢測到20個與硫苷含量顯著關聯的SNP位點,分別位于A02、A03、A09、C03、C08、C09染色體上。對這些顯著關聯的SNP位點側翼序列進行連鎖不平衡分析,檢測到C03染色體上的單體型區域(57830409~58283210 bp;r2=0.96)與硫苷含量顯著關聯。在這個單體型區域檢測到了一個擬南芥(Arabidopsis thaliana)的直系同源基因支鏈氨基轉移酶4 (branched-chain aminotransferase 4, BCAT4),涉及硫苷的合成。同時,利用50個重測序材料對這個單體型區域進行了進一步的區域關聯分析,揭示BnBCAT4-C03 (BnaC03g68450D)基因區域單體型結構變異影響了硫苷的積累。結合基因共表達網絡分析結果,表明BnBCAT4-C03與其他硫苷合成的重要基因形成了分子網絡,調節硫苷的合成與積累。本研究結果有助于開發單體型功能標記,為極端低硫代品種選育提供理論指導。

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