關(guān)鍵詞：芥菜 tcp家族 全基因組鑒定 進(jìn)化分析 表達(dá)分析 

摘要：【目的】對(duì)芥菜基因組中TCP轉(zhuǎn)錄因子家族基因成員進(jìn)行鑒定和序列分析,并分析TCP家族基因在莖發(fā)育時(shí)期的表達(dá)水平,為研究芥菜TCP基因功能和莖膨大機(jī)理提供基因源和理論依據(jù)。【方法】從蕓薹屬基因組數(shù)據(jù)庫下載芥菜基因組數(shù)據(jù),結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),對(duì)芥菜TCP轉(zhuǎn)錄因子家族成員進(jìn)行鑒定,并利用生物信息學(xué)方法對(duì)該家族成員進(jìn)行理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)、染色體定位及莖不同發(fā)育時(shí)期基因表達(dá)譜等方面的分析。【結(jié)果】芥菜TCP家族共有53個(gè)成員;系統(tǒng)進(jìn)化樹分析可分為兩個(gè)大的亞組;TCP基因大都位于細(xì)胞核上,但理化性質(zhì)差異很大;大部分基因沒有內(nèi)含子,基因結(jié)構(gòu)保守性較高;在染色體上分布不均;表達(dá)模式分析顯示TCP家族基因可能在芥菜莖膨大中起重要作用。【結(jié)論】鑒定了53個(gè)芥菜TCP家族基因成員,并發(fā)現(xiàn)PCF亞組成員在芥菜莖發(fā)育時(shí)期特異性表達(dá),可能在芥菜莖的生長發(fā)育過程中起重要作用,該研究為芥菜及其他植物中TCP家族的鑒定和功能研究提供了理論基礎(chǔ)。

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