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樹鼩PSEN1全長編碼序列的克隆及分子特征分析

李明學; 王文廣; 李娜; 匡德宣; 仝品芬; 黃鑫; 黎曉慧; 孫曉梅; 陸彩霞 中國醫學科學院/北京協和醫學院醫學生物學研究所樹鼩種質資源中心; 昆明650118; 昆明醫科大學; 昆明650500

關鍵詞:樹鼩 psen1 分子克隆 系統發育分析 

摘要:目的 獲取樹鼩早老素蛋白-1(PSEN1)的全長編碼序列并進行分子特征分析。方法 以樹鼩腦組織總RNA為材料,通過RT-PCR、RACE-PCR擴增和序列拼接獲得PSEN1基因全長編碼序列,進而通過DNAMAN、MEGA等生物信息學軟件對其序列和分子特征進行分析。qRT-PCR和Western Blot進一步分析PSEN1在樹鼩各個組織的表達模式。結果 克隆鑒定了樹鼩PSEN1基因,其cDNA的開放閱讀框全長1128 bp,編碼375個氨基酸。通過系統發育譜系樹、氨基酸序列對比分析,發現樹鼩PSEN1與小鼠、大鼠等相比更接近人類和非人靈長類動物。qRT-PCR和Western Blot的結果表明,樹鼩PSEN1在腦組織的表達量明顯高于其他臟器組織。結論 通過克隆樹鼩PSEN1基因序列并進行分析,為今后進一步深入研究該基因功能和建立相關疾病動物模型提供理論基礎。

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