關鍵詞：腦炎病毒 乙型 基因分型 e基因 

摘要：目的 對2009年武漢市新分離的2株乙型腦炎（簡稱乙腦）病毒進行基因分型和序列分析，了解本地乙腦病毒株的分子生物學特性。方法 將2009年從三帶喙庫蚊中分離的兩株乙型腦炎病毒用RT-PCR法擴增E基因，將其進行測序，并用DNAstar and MegAlign軟件與其他基因型代表株進行比對。結果 16組樣品檢出兩株陽性（WHJX9-09、WHJX10-09），這兩株陽性均屬于GI型。兩株新分離JEV之間的核苷酸和氨基酸同源性分別為98.9％和100％。同目前在武漢市使用的疫苗株SA-14-14-2相比，核苷酸同源性分別為87.4％、87.9％，氨基酸同源性為96.9％。共有15個氨基酸發生變異分布在3個不同結構域，中和位點沒有變異但是神經毒力位點仍然存在。結論 武漢市本地新分離乙腦病毒基因型為GI型，不同于1988年在武漢檢出的GⅢ型的基因型，和疫苗株SA-14-14-2相比，其神經毒力并沒有減弱，但疫苗產生的抗體對新出現的GI型乙腦病毒仍有中和作用。因此提高乙腦疫苗的接種率并配合防蚊滅蚊措施對控制乙腦疫情依然至關重要。同時有必要對本市蚊蟲及乙腦患者進行長期的病原學監測工作，為乙腦預測預警體系的建立提供科學依據。

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